Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kiaa1549Q68FD9 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms