Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sbno1Q689Z5 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms