Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa17Q64016 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.5 ms