Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Col4a5Q63ZW6 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Col4a5Q63ZW6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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