Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Gm22616-201ENSMUST00000179783 100 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Gm44173-201ENSMUST00000204316 132 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Gm23908-201ENSMUST00000104599 132 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Tomm5-203ENSMUST00000107809 738 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 AC124772.3-201ENSMUST00000222535 575 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Gm3404-201ENSMUST00000110596 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Gm12037-201ENSMUST00000123160 308 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Yipf7-201ENSMUST00000031045 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Mcu-201ENSMUST00000009791 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ncor1Q60974 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms