Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm38393-201ENSMUST00000179360 1199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm42822-201ENSMUST00000200507 1529 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm45114-201ENSMUST00000208280 1349 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tsr1Q5SWD9 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms