Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shank3Q4ACU6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shank3Q4ACU6 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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