Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Ccdc185Q3V118 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Ccdc185Q3V118 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Ccdc185Q3V118 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
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Ccdc185Q3V118 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc185Q3V118 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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