Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp48Q3V0C5 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms