Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kdm5aQ3UXZ9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms