Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6899Q3USS0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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