Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Znf48Q3US17 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 AC115784.1-201ENSMUST00000227687 1010 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Znf48Q3US17 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Znf48Q3US17 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Znf48Q3US17 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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