Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm5460Q3UQ97 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm5460Q3UQ97 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5460Q3UQ97 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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