Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms