Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Sult2a1-201ENSMUST00000108522 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm9392-201ENSMUST00000119337 554 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm26590-201ENSMUST00000180857 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 AC163638.1-201ENSMUST00000224818 392 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Olfr1432-202ENSMUST00000207710 2068 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam117bQ3U3E2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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