Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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Rnf40Q3U319 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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Rnf40Q3U319 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Rnf40Q3U319 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Rnf40Q3U319 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rnf40Q3U319 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rnf40Q3U319 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rnf40Q3U319 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rnf40Q3U319 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rnf40Q3U319 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Rnf40Q3U319 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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