Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Rnf149Q3U2C5 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Rnf149Q3U2C5 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Rnf149Q3U2C5 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Rnf149Q3U2C5 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Rnf149Q3U2C5 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Rnf149Q3U2C5 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Rnf149Q3U2C5 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Rnf149Q3U2C5 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Rnf149Q3U2C5 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Rnf149Q3U2C5 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Rnf149Q3U2C5 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf149Q3U2C5 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf149Q3U2C5 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf149Q3U2C5 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Rnf149Q3U2C5 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf149Q3U2C5 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf149Q3U2C5 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf149Q3U2C5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf149Q3U2C5 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
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Rnf149Q3U2C5 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
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Rnf149Q3U2C5 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf149Q3U2C5 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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