Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
InipQ3TXT3 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms