Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srsf6Q3TWW8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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