Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms