Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd300lgQ1ERP8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms