Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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