Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rundc1Q0VDN7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms