Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itgb8Q0VBD0 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms