Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Kcnb1Q03717 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Kcnb1Q03717 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms