Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Runx1Q03347 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Runx1Q03347 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms