Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms