Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SeleQ00690 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms