Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp46P62069 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp46P62069 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp46P62069 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Usp46P62069 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp46P62069 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp46P62069 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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Usp46P62069 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Usp46P62069 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Usp46P62069 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Usp46P62069 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Usp46P62069 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Usp46P62069 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Usp46P62069 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Usp46P62069 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Usp46P62069 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Usp46P62069 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp46P62069 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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