Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TspoP50637 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TspoP50637 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TspoP50637 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TspoP50637 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
TspoP50637 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TspoP50637 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TspoP50637 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms