Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
GdnfP48540 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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