Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrprbP47758 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrprbP47758 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms