Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LtbP41155 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
LtbP41155 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtbP41155 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtbP41155 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtbP41155 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtbP41155 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtbP41155 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtbP41155 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtbP41155 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtbP41155 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtbP41155 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtbP41155 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtbP41155 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtbP41155 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtbP41155 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtbP41155 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LtbP41155 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LtbP41155 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms