Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cd28P31041 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms