Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprmP28828 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprmP28828 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprmP28828 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprmP28828 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprmP28828 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprmP28828 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprmP28828 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprmP28828 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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