Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Defa5P28312 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Defa5P28312 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms