Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ChgaP26339 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChgaP26339 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChgaP26339 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ChgaP26339 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChgaP26339 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChgaP26339 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ChgaP26339 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ChgaP26339 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ChgaP26339 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChgaP26339 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ChgaP26339 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ChgaP26339 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChgaP26339 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ChgaP26339 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChgaP26339 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ChgaP26339 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ChgaP26339 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChgaP26339 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ChgaP26339 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ChgaP26339 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ChgaP26339 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChgaP26339 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChgaP26339 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ChgaP26339 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChgaP26339 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChgaP26339 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChgaP26339 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChgaP26339 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChgaP26339 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChgaP26339 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChgaP26339 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChgaP26339 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ChgaP26339 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ChgaP26339 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChgaP26339 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ChgaP26339 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms