Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Hoxd12P23812 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Hoxd12P23812 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Hoxd12P23812 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Hoxd12P23812 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Hoxd12P23812 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Hoxd12P23812 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Hoxd12P23812 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Hoxd12P23812 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd12P23812 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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