Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
P10404 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
P10404 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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