Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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H2-Ab1P01921 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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H2-Ab1P01921 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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H2-Ab1P01921 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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H2-Ab1P01921 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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H2-Ab1P01921 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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H2-Ab1P01921 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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H2-Ab1P01921 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-Ab1P01921 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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