Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Cops6O88545 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cops6O88545 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cops6O88545 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops6O88545 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cops6O88545 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cops6O88545 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cops6O88545 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cops6O88545 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cops6O88545 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops6O88545 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops6O88545 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops6O88545 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops6O88545 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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