Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Eftud2O08810 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms