Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms