Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
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Phf11bB4XVQ1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf11bB4XVQ1 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms