Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt4B2RU40 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms