Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Uhrf1bp1B2KF50 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Uhrf1bp1B2KF50 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms