Protein–RNA interactions for Protein: V9GXQ2

Gm17087, Predicted gene 17087, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17087V9GXQ2 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17087V9GXQ2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms