Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hdac6Q9Z2V5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac6Q9Z2V5 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac6Q9Z2V5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac6Q9Z2V5 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac6Q9Z2V5 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac6Q9Z2V5 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac6Q9Z2V5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac6Q9Z2V5 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac6Q9Z2V5 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac6Q9Z2V5 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac6Q9Z2V5 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac6Q9Z2V5 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hdac6Q9Z2V5 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac6Q9Z2V5 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hdac6Q9Z2V5 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac6Q9Z2V5 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hdac6Q9Z2V5 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hdac6Q9Z2V5 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac6Q9Z2V5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac6Q9Z2V5 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac6Q9Z2V5 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac6Q9Z2V5 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac6Q9Z2V5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac6Q9Z2V5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac6Q9Z2V5 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac6Q9Z2V5 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms