Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn8Q9Z260 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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