Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Syngr4Q9Z1L2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms